python版，使用TotalSegmentator工具可在1分钟内自动分割全身117个器官，附批量技巧，Python版，快速自动分割全身器官，使用TotalSegmentator工具及批量处理技巧

摘要：使用Python版的TotalSegmentator工具，能够在1分钟内自动分割全身的117个器官，极大提高了医学影像处理的效率。该工具还提供了批量处理技巧，可以一次性处理多个影像数据，进一步节省了处理时间。这一技术的应用，为医疗诊断和研究带来了极大的便利。

概述

TotalSegmentator是一个用于对CT图像中超过117个类别进行自动分割的工具，它接受各种不同CT图像（来自不同扫描仪、机构、协议等）的训练，因此适用于大多数图像，大部分训练数据集可从Zenodo下载（1228个主题），您还可以在totalsegmentator.com上在线试用该工具。

主要特点

1、在大型数据集上使用nnUNet V2训练的AI模型。

2、能在CT数据上自动分割全身117个器官（具体器官列表详见后文）。

3、还可以分割部分血管、脑出血、胸腔积液等。

使用方法

1、安装与要求：

* TotalSegmentator可在Ubuntu、Mac和Windows以及CPU和GPU上运行。

* 需要Python 3.9及以上版本。

* 依赖项包括Python和PyTorch 1.12.1及以上版本。

2、安装TotalSegmentator：直接在终端（选择合适的虚拟环境）使用pip进行安装。

3、使用方法：

* 使用命令行接口使用TotalSegmentator。

* 输入参数包括CT图像的路径、输出文件夹等。

* 还可以添加各种参数进行高级使用，例如分割单一器官、预览分割结果等。

4、高级功能：

* 除了自动分割所有器官外，还可以分割一些子任务。

* 提供了在Python中运行TotalSegmentator的方法。

可分割的器官列表

包括脾脏、肾脏、胆囊、肝脏、胃、胰腺等，以及食管、气管、甲状腺、小肠、十二指肠、结肠等，还包括心脏、主动脉、肺静脉等血管结构，以及肋骨、头骨等骨骼结构，具体可分割的器官列表详见原文。

注意事项

1、确保CT图像的质量和数据完整性。

2、根据实际需求选择合适的版本（3D Slicer版本或Python版本）。

3、使用时需注意参数设置，以获得最佳的分割效果。

仅供参考，如需获取更详细的使用方法和更多信息，建议查阅官方文档或联系技术支持。